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中国科学院亚热带农业生态研究所
亚热带农业生态研究所创建于1978年，其前身为中国科学院长沙农业现代化研究所，2003年10月改为现名。亚热带生态所主要学科方向为亚热带复合农业生态系统生态学，下设农牧复合生态研究与畜禽健康养殖研究中心、作物耐逆境分子生态中心等两个研究中心，作为依托单位拥有畜禽养殖污染控制与资源化技术国家工程实验室、中国科学院亚热带农业生态过程重点实验室、农业生态工程湖南省重点实验室、动物营养生理与代谢过程湖南省重点实验室、湖南省畜禽健康养殖工程技术研究中心和广西石漠化治理工程技术研究中心，建有桃源农业生态系统观测研究站、环江喀斯特生态系统观测研究站、洞庭湖湿地生态系统观测研究站和长沙农业环境观测研究站。
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中国科学院地理科学与资源研究所
中国科学院地理科学与资源研究所于1999年9月经中国科学院批准，由中国科学院地理研究所(前身是1940年成立的中国地理研究所)和中国科学院自然资源综合考察委员会（1956年成立）整合而成。地理资源所的定位是：以解决关系国家全局和制约长远发展的资源环境领域的重大公益性科技问题为着力点，以持续提升研究所自主创新能力和可持续发展能力为主线，建设成为服务、引领和支撑我国区域可持续发展的资源环境研究战略科技力量。发展目标是：成为在我国陆地表层过程、区域可持续发展、资源环境安全、生态系统及地理信息系统核心科学与技术研究中起引领作用的综合研究机构，成为国家区域发展、资源利用、环境整治和生态文明建设重要的思想库、人才库，成为国际地理科学、资源科学和生态建设领域的著名综合性研究机构。
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中国地震局工程力学研究所
中国地震局工程力学研究所（简称工力所）筹建于1952年，正式成立于1954年，最初定名为中国科学院土木建筑研究所，是国内唯一以地震工程和防灾减灾为主要研究领域的国家公益性科研机构。建所以来，工力所服务国家战略需求和经济社会发展，始终围绕现代化建设需要开展科学研究，主攻研究领域逐步调整。工力所现设有强震动观测、工程地震、结构工程、生命线工程、城市与工程综合防灾、岩土工程、振动测量仪器等七个研究室和恢先地震工程综合实验室。
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中国科学院北京基因组研究所
基因组所成立于2003年11月，2019年11月加挂“国家生物信息中心”牌子。国家生物信息中心面向我国人口健康、社会可持续发展和信息安全的重大战略需求和科学前沿，承担国家生物信息大数据统一汇交、集中存储、安全管理与开放共享以及前沿交叉研究和转化应用等工作，研究所迈入新的历史发展阶段。
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中国科学院动物研究所
中国科学院动物研究所历史悠久，其前身是1928年成立的静生生物调查所、1929年成立的北平研究院动物学研究所和1930年成立的中央研究院动物研究所。1950年，中国科学院接收了上述三个研究所的部分资料、标本和设备，成立了中国科学院昆虫研究室和动物标本整理委员会。二者分别于1953年和1957年进一步发展为昆虫研究所和动物研究所，之后1962年两所合并成为现在的动物研究所。动物研究所在国家自然资源调查、自然保护区设立、虫鼠害防治、珍稀濒危动物保护、生殖避孕等领域做出过重要历史贡献。近年来，多位国家领导人和中国科学院及各部委领导到动物研究所视察工作，对研究所发展战略、学科目标凝练、园区建设、科研进展、人才培养等方面提出重要指示。动物研究所是以动物科学基础研究为主的社会公益型国家级科研机构。以野生动物和模式动物为研究对象，开展现代动物学研究，服务于人口健康、农业和生物多样性保护等国家重大需求。在细胞编程与重编程的机制、生殖与发育调控、生物灾害爆发机制与控制、物种濒危机制与保护等领域发挥引领作用；在动物分类与进化、农业虫鼠害防控和濒危动物保护中发挥不可替代的作用。
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中国科学院水利部成都山地灾害与环境研究所
成都山地所由1965年成立的中国科学院地理研究所西南地理研究室发展而来。成都山地所以“认知山地科学规律，服务国家持续发展”为战略目标，其基本定位是以山地灾害、山地环境和山区可持续发展为主要研究领域，致力于为“增强我国防御山地灾害能力、保障山区生态安全和促进经济社会发展”提供科学依据和技术支撑。成都山地所拥有中科院山地灾害与地表过程重点实验室、中科院山地表生过程与生态调控重点实验室、山区发展研究中心和数字山地与遥感应用中心四个研究学科单元，设有四川省山区减灾工程技术研究中心和综合测试与模拟试验中心两个关键支撑平台，建立了以中科院东川泥石流观测研究站、中科院贡嘎山高山生态系统观测试验站、中科院盐亭紫色土农业生态试验站等3个国家重点野外台站和其他6个院所级台站构成的长江上游、西藏高原环境灾害与生态安全观测平台，参与共建国家工程实验室1个，参与共建国家测绘局工程技术中心1个，建有1个480m2的科技展馆。
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中国科学院南京天文光学技术研究所
南京天光所由原中国科学院南京天文仪器研制中心（前身为1958年成立的原中国科学院南京天文仪器厂）的科研部分和高技术镜面实验室于2001年4月组建而成。南京天光所拥有中国科学院天文光学技术重点实验室，另设有望远镜新技术研究室、天文光谱和高分辨成像技术研究室、太阳仪器研究室、镜面技术实验室、大口径光学技术研究室、望远镜工程中心和南极天文技术中心等科研部门，并建有主动光学、系外行星探测、自适应光学、激光光谱技术、恒星光干涉、光学镀膜、低温环境模拟等20多个专业实验室，拥有先进的实验条件、平台和装备。
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中国科学院成都生物研究所
中国科学院成都生物研究所（以下简称成都生物所）成立于1958年，是以一级学科建所的中国科学院直属科研事业单位，也是中国科学院知识创新工程首批试点单位之一。长期以来，研究所致力于生物多样性保护与生物资源可持续利用研究，为长江上游地区生态环境建设与生物多样性保护以及战略新兴生物产业的形成与升级提供科学基础、技术支撑与决策依据。成都生物所设有天然产物研究中心、生态研究中心、两栖爬行动物研究室、应用与环境微生物研究中心、农业生物技术研究中心等5个研究机构，是国家天然药物工程技术研究中心、中国科学院山地生态恢复与生物资源利用重点实验室、生态保育与生物多样性保护四川重点实验室、中国科学院环境与应用微生物重点实验室、环境微生物四川省重点实验室、中国科学院四川转化医学研究医院的依托单位。
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中国科学院天津工业生物技术研究所
中国科学院天津工业生物技术研究所是由中国科学院和天津市人民政府共建、从事生物技术创新推动工业领域生态发展的科研机构，2012年3月获中央机构编制委员会批准成立，2012年11月29日通过验收，正式成为中国科学院序列研究所。天津工业生物所肩负着建立我国工业生物技术创新体系、促进工业绿色升级的历史使命，其战略定位是：面向国民经济主战场，以新生物学为基础，以“人工生物”设计创建为核心，发展生命科学，创新生物技术，引领我国工业生物科技进步，构建工业经济发展的生态路线，打通科技创新价值链，服务于社会经济可持续发展。
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中国科学院武汉岩土力学研究所
武汉岩土所创建于1958年，是专门从事岩土力学基础与应用研究、以工程应用背景为特征的综合性研究机构。武汉岩土所下设岩土力学与工程国家重点实验室、湖北省环境岩土工程重点实验室、污染泥土科学与工程湖北省重点实验室、能源与废弃物地下储存研究中心、湖北省固体废弃物安全处置与生态高值化利用工程技术研究中心、岩土力学与工程实验测试中心、中国岩土工程研究中心、武汉岩土工程检测中心等研究、开发与支撑平台；以及武汉中科岩土投资有限责任公司、武汉中岩科技有限公司、武汉中科岩土工程有限责任公司、武汉中力岩土工程有限公司和武汉中科科创工程检测有限公司等产业化平台。
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