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河南省科学院
河南省科学院官网。河南省科学院创建于1958年，前身为中国科学院河南分院。目前已成为河南省唯一的省属综合性自然科学研究机构，也是全国规模较大、综合实力较强的省级科学院之一，目前是省政府直属正厅级事业单位，也是省政府与中科院共建单位、全国科学院联盟成员单位和省院合作的依托基地。系统内共有16家二级机构。公益性科研机构3家、改制科研机构9家、国有全资企业4家。拥有学术期刊5个，其中，《河南科学》、《地域研究与开发》是核心期刊。
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中国科学院兰州分院
兰州分院成立于1954年，是中国科学院在全国共12个分院之一，作为中科院机关的派出机构，负责联系在甘肃和青海的院属科研单位。包括：近代物理研究所、兰州化学物理研究所和西北生态环境资源研究院（2016年6月整合了寒区旱区环境与工程研究所、兰州油气资源研究中心、兰州文献情报中心以及西北高原生物研究所、青海盐湖研究所组建而成）。
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中国科学院空天信息创新研究院
中国科学院空天信息创新研究院在中国科学院电子学研究所、遥感与数字地球研究所、光电研究院的基础上整合组建，于2017年7月29日由中国科学院院长办公会议审议通过。其中，电子学研究所创建于1956年，为我国第一个综合型电子与信息科学研究所；遥感与数字地球研究所于2012年在原遥感应用研究所（1979年）、对地观测中心（2007年）基础上组建，为我国遥感科学与综合应用技术研究机构；光电研究院组建于2003年，是光电工程、航天航空和应用科技等三个主要领域兼具总体管理与技术总体职能的高技术研究单位。空天院拥有20个国家级/院级重点实验室、中心、非法人单位，依托原有几个研究机构的核心竞争力，聚焦国家战略需求，以重大产出和支撑国家实验室建设为目标，已基本形成了空天信息领域高起点、大格局、全链条布局的研究方向。
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中国科学院计算技术研究所
计算所创建于1956年，是中国第一个专门从事计算机科学技术综合性研究的学术机构。计算所研制成功了我国第一台通用数字电子计算机，并形成了我国高性能计算机的研发基地，我国首枚通用CPU芯片也诞生在这里。
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中国科学院网络科普联盟
通过科普资源的共享和网络技术的有效应用，促进中国科学院科学资源的公众普及，提升全民科学素养。
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中国科学院国家空间科学中心
中国科学院国家空间科学中心是我国空间科学及其卫星项目和中国科学院月球与深空探测任务的总体性研究机构，我国空间科学领域的研究中心和创新高地，负责组织开展国家空间科学发展战略规划研究，具体负责中国科学院空间科学先导专项的组织与实施，开展空间科学及相关应用领域的创新性科学研究与技术发展和试验工作。空间中心的历史可以追溯至1958年为研制“东方红一号”卫星而组建的中国科学院“581”组，几经辗转变迁，已走过了一个多甲子的不平凡历程。从中国科学院“581”组到中国科学院地球物理所二部、应用地球物理所、航天五院505所，再到中国科学院空间物理研究所、中国科学院空间科学技术中心和空间科学与应用研究中心，2015年经中央编办批复，正式更名为中国科学院国家空间科学中心。
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中国科学院计算机网络信息中心
中国科学院计算机网络信息中心成立于1995年3月，是中国科学院科研信息化与管理信息化的系统集成、运行和服务保障机构，信息化应用技术的研发和示范基地。1994年4月20日，一条64K的国际专线从计算机网络信息中心连入Internet，实现了中国与Internet的全功能连接，从此中国成为第77个真正拥有全功能Internet的国家。二十余年来，中心立足支撑与服务全院科研信息化和管理信息化，汇聚管理信息化资源，发挥了科研应用的信息化、学科交叉开放融合、科学思想传播和科研信息化理念传播的先遣队作用，成为我院信息化基础设施建设、运维和信息化基础服务的一支中坚力量，成为引领中国科研信息化建设和运行服务的一流信息中心。计算机网络信息中心运行和管理我国最早的互联网骨干网之一的中国科技网（CSTNET），是国际学术网络的重要成员，与国内各互联网骨干网和欧美主要学术网络高速互联，承担着国家下一代互联网示范工程任务，在未来网络、云计算等前沿技术领域是国内一支重要力量。
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中国科学院大气物理研究所
中国科学院大气物理研究所，起源于1928年由著名气象学家竺可桢先生创立的国立中央研究院气象研究所。1950年1月，中国科学院将气象、地磁和地震等部分科研机构合并组建成立中国科学院地球物理研究所。1966年1月，根据我国气象事业发展的需要，中国科学院决定将气象研究室从地球物理研究所分出，正式成立中国科学院大气物理研究所。大气所致力于研究和探索地球大气中和大气与周边环境相互作用中的物理、化学、生物、人文过程的新规律；提供天气、气候和环境监测、预测和调控的先进理论、方法和技术；造就本领域的一流人才；服务于经济和社会的可持续发展和国家安全。主要研究方向：地球系统模式发展与全球气候变化研究、大气化学、大气环境变化及其预测机理研究、东亚季风气候系统动力学研究与气候预测、中层大气过程与大气遥感研究、高影响天气的物理、动力及可预报性研究、全球及区域气候环境变化集成研究与有序适应。大气所现有2个国家重点实验室，4个中国科学院重点实验室，4个所级实验室和研究中心。
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中国科学院烟台海岸带研究所
中国科学院烟台海岸带研究所筹建于2006年，正式成立于2009年12月1日，由中国科学院与山东省、烟台市三方共建，是专门从事海岸带综合研究的唯一国立研究机构。研究所现有中国科学院海岸带环境过程与生态修复重点实验室、海岸带生物学与生物资源利用重点实验室、山东省海岸带环境过程重点实验室、山东省海岸带环境工程技术研究中心，有中国科学院牟平海岸带环境综合试验站、中国科学院黄河三角洲滨海湿地生态试验站、中国科学院烟台海岸带生物产业技术创新与育成中心，有500吨级“创新一”科学考察船。
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中国科学院新疆生态与地理研究所
新疆生地所始建于1961年，是中科院部署在新疆的一支国家科技力量。研究所面向国际干旱区生态与环境领域科技前沿，面向国家丝绸之路经济带建设重大需求，面向新疆社会稳定与长治久安总目标，围绕干旱区自然资源开发、生态修复、环境治理、生物多样性保育和区域可持续发展等重大问题，重点开展丝绸之路经济带生态、环境监测和评估、区域水资源利用与生态安全、新疆及中亚矿产探测与环境治理、干旱区战略生物资源可持续利用、新疆农牧民增收和区域发展等研究，创新干旱区自然地理学、荒漠恢复生态学、绿洲农业生态学的理论和方法体系，在亚洲中部干旱区生态与环境领域发挥不可替代的骨干和引领作用。在科研机构设置方面，建有荒漠与绿洲生态国家重点实验室、中科院干旱区生物地理与生物资源重点实验室、国家荒漠-绿洲生态建设工程技术研究中心；中科院-新疆维吾尔自治区政府共建中科院新疆矿产资源研究中心。在国内建有12个野外台站（其中3个为国家级野外站），另有分析测试中心、文献信息中心、标本馆等科研支撑平台。国际科研平台建设方面，建有中国科学院中亚生态与环境研究中心、中美国际干旱区生态研究中心、中日干旱区生态研究中心等。
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