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中国科学院数学与系统科学研究院
中国科学院数学与系统科学研究院成立于1998年12月，是由中科院数学研究所(建于1952年)、应用数学研究所(建于1979年)、系统科学研究所(建于1979年)及计算数学与科学工程计算研究所(建于1995年)等四个研究所整合而成。研究院是一个综合性的国立学术研究机构，覆盖了数学与系统科学的主要研究方向。研究院新时期的办院方针是：在数学与系统科学领域，面向国际发展前沿，面向国家战略需求，做出原创性、突破性和关键性的重大理论成果与应用成果，造就具有国际重要影响的学术带头人和一批杰出人才。研究院的发展目标是：在数学与系统科学领域内，成为国际上有重要影响的研究中心、培养和造就高级研究人才的著名中心、国民经济和国防建设有关问题研究和咨询的重要中心。
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中国科学院重庆绿色智能技术研究院
重庆绿色智能技术研究院是中国科学院、国务院三峡办、重庆市人民政府三方共建的中国科学院直属科研机构，2012年7月26日获得中央机构编制委员会办公室批复。重庆研究院设立学术委员会和战略咨询委员会，设电子信息技术研究所、智能制造技术研究所、三峡生态环境研究所、生物医药与健康研究所（筹）。
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中国社会科学院世界历史研究所
中国社会科学院世界历史研究所成立于1964年5月，前身为1959年设在中国科学院哲学社会科学部历史研究所的世界历史研究组；1962年扩建为世界历史研究室；1964年5月，经中华人民共和国国务院批准，在研究室的基础上扩编，正式建成世界历史研究所，它是中国社会科学院对世界主要国家和地区的历史进行综合性研究的专门学术机构。研究方向与任务：以研究世界近、现代历史为主，同时开展对世界古代和中世纪历史的研究。在国别史研究的基础上进行跨时代、跨国别、跨地区的专题研究；探讨和阐述人类社会发展的规律，特别是自16世纪以来世界各国政治、经济、文化发展演变的统一性、多样性与历史经验；探讨和阐述史学理论和方法论在历史研究中的地位和作用；阐述资本主义社会发生、发展的规律和社会主义革命和建设的历史经验与教训。
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中国科学院知识服务平台
中国科学院文献情报中心（北京中关村北四环西路33号）门户网站，内容包括到馆服务、学科服务、研究支持、研究报告、数据资源、科学传播等。
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中国科学院北京综合研究中心
北京综合中心筹建于2011年10月9日，2012年7月26日经中央机构编制委员会批准正式设立，2017年11月顺利通过院党组筹建验收。北京综合中心主要负责国家重大科技基础设施及院市共建交叉研究平台的规划建设；物质科学、空间科学等六个科学中心在怀柔科学城的规划落实；京区研究所在怀柔科学城相关工作拓展的综合服务。
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中国科学院深圳先进技术研究院
深圳先进技术研究院于2006年2月建立。目前已初步构建了以科研为主的集科研、教育、产业、资本为一体的微型协同创新生态系统，由九个研究平台（中国科学院香港中文大学深圳先进集成技术研究所、生物医学与健康工程研究所、先进计算与数字工程研究所、生物医药与技术研究所、广州中国科学院先进技术研究所、脑认知与脑疾病研究所、合成生物学研究所、先进材料科学与工程研究所（筹）、前瞻性科学与技术中心），国科大深圳先进技术学院，多个特色产业育成基地（深圳龙华、平湖及上海嘉定）、多支产业发展基金、多个具有独立法人资质的新型专业科研机构（深圳创新设计研究院、深圳北斗应用技术研究院、中科创客学院、济宁中科先进技术研究院、天津中科先进技术研究院、珠海中科先进技术研究院、苏州先进技术研究院、杭州先进技术研究院、武汉中科先进技术研究院、山东中科先进技术研究院）等组成。
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中国科学院科技战略咨询研究院
中国科学院科技战略咨询研究院是中国科学院学部发挥国家科学技术方面最高咨询机构作用的研究和支撑机构，是中国科学院率先建成国家高水平科技智库的重要载体和综合集成平台，并集成中国科学院院内外以及国内外优势力量建设创新研究院。战略咨询院设有科技发展战略研究所、创新发展政策研究所、可持续发展战略研究所、系统分析与管理研究所、科技战略情报研究所等5个研究所。设有学部咨询研究支撑中心、学部学科研究支撑中心、学部科学规范与伦理研究支撑中心、学部科普与教育研究支撑中心等4个学部研究支撑中心，另有第三方评估研究支撑中心，为学部和中科院院部开展第三方评估任务提供支撑。战略咨询院还建有6个中科院院级研究中心，包括中国科学院中国创新战略和政策研究中心、中国科学院战略研究中心、中国科学院创新发展研究中心、中国科学院自然与社会交叉科学研究中心、中国科学院管理创新与评估研究中心、中国科学院知识产权研究与培训中心。
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中国社会科学院古代史研究所
中国社会科学院古代史研究所是中国社会科学院直属事业单位，是我国历史学领域的国家级学术机构和研究中心，主要从事中国古代断代史和专门史学科的研究工作。1954年，中国科学院建立了历史研究所第一所、第二所。1960年2月26日中央批准中国科学院历史研究所第一所和第二所合并为中国历史研究所。1977年，中国社会科学院成立，历史研究所由此成为中国社会科学院的下属机构之一。2019年，中国历史研究院成立，历史研究所更名为古代史研究所。目前，古代史研究所已经发展成为集断代史研究、专门史研究于一体，着力于基础研究，兼顾应用对策研究的历史研究专业性机构。研究时段上起原始社会，下迄1840年以前的中国历史。现设有先秦史、秦汉史、魏晋南北朝史、隋唐五代十国史、宋辽西夏金史、元史、明史、清史、古代思想史、古代文化史、古代社会史、古代中外关系史、历史地理、古代通史等14 个研究室。同时设有综合处、《中国史研究》编辑部、图书馆等管理和科研辅助部门。办有各类学术期刊（集刊）13种。
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中国科学院合肥物质科学研究院应用技术研究所
应用技术所主要定位是：以促进区域经济的可持续发展为导向，以技术原始创新、集成创新为为基点，以专业特色学科为依托，以研发具有重要应用前景的新型产业技术为目标，吸引并凝聚国内外优秀人才，构筑高水平技术创新人才培养基地，探索以市场需求为导向的科研体制和机制，建设成为一流的应用技术创新平台。
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中国科学院半导体研究所
1960年9月6日在北京成立中国科学院半导体研究所，开启了中国半导体科学技术的发展之路。半导体所拥有两个国家级研究中心—国家光电子工艺中心、光电子器件国家工程研究中心；三个国家重点实验室—半导体超晶格国家重点实验室、集成光电子学国家重点联合实验室、表面物理国家重点实验室(半导体所区)；三个院级实验室(中心)—半导体材料科学重点实验室、中科院半导体照明研发中心和中科院固态光电信息技术重点实验室。此外，还设有半导体集成技术工程研究中心、光电子研究发展中心、高速电路与神经网络实验室、纳米光电子实验室、光电系统实验室、全固态光源实验室和元器件检测中心。
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