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中国科学院上海技术物理研究所
上海技物所创建于1958年10月，是集基础研究、工程技术研发和高新技术产业化为一体的综合型研究机构。上海技物所以红外物理与光电技术研究为定位，以红外光电新材料、新器件、新方法等作为主要研究方向，重点发展先进的航空航天有效载荷、红外凝视成像及信号处理、红外焦平面及遥感信息处理等技术。设有研究室13个，建有红外物理国家重点实验室、传感技术联合国家重点实验室（光传感器专业点）、中科院红外成像材料与器件重点实验室、中科院红外探测与成像技术重点实验室、中科院空间主动光电技术重点实验室、中科院智能红外感知重点实验室以及省部共建现场物证光学探测技术联合实验室。
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中科院昆明植物研究所
中国科学院昆明植物研究所前身是静生生物调查所和云南省教育厅于1938年7月合作成立的云南农林植物研究所。1950年4月转属中国科学院，更名为中国科学院植物分类研究所昆明工作站。1953年3月更名为中国科学院植物研究所昆明工作站。1959年4月，经国家科委批准，正式成立中国科学院昆明植物研究所。研究所将植物分类与生物地理、植物化学与天然产物研发、野生种质资源保藏与利用、民族植物学与区域发展、资源植物研发与产业化这五个方面为重点研究领域。研究所建有昆明和丽江两个园区，其中昆明占地面积1018亩。研究系统设置“三室一库”，即植物化学与西部植物资源持续利用国家重点实验室、中国科学院东亚植物多样性与生物地理学重点实验室、资源植物与生物技术重点实验室、中国西南野生生物种质资源库。植物标本馆（KUN）馆藏标本150余万份，是全国第二大植物标本馆。种质资源库已累计采集保存种子总量达10,285种，82,746份，种数超过中国种子植物总数的1/3。现有控股企业1家，参股企业4家：其中云南云投生态环境科技股份有限公司为深圳证券交易所上市企业，云南西力生物技术股份有限公司为新三板挂牌企业。
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生物化学与细胞生物学研究所
生化与细胞所）成立于2000年5月，由原中国科学院上海生物化学研究所与原中国科学院上海细胞生物学研究所整合而成。生化与细胞所是我国生命科学领域最具科研实力和影响力的国立研究机构之一。研究所定位于生命科学基础研究，在PI制的基础上，针对当今生物化学和细胞生物学主要前沿研究方向，围绕国家重点实验室和研究中心形成了三大研究集群，涵盖五大前沿领域。形成了以分子生物学国家重点实验室、细胞生物学国家重点实验室、国家蛋白质科学研究中心•上海（筹）为支撑的三大研究集群，涵盖基因调控、RNA、表观遗传学，蛋白质科学，细胞信号转导，细胞与干细胞生物学，癌症和其它重大疾病机理五大前沿领域。
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中国科学院遗传与发育生物学研究所农业资源研究中心
中国科学院遗传与发育生物学研究所农业资源研究中心的前身为中国科学院石家庄农业现代化研究所。1978年，国家为加强农业综合研究能力、适时转化农业科研成果、推进农业现代化建设与发展，经报请中央批准，中国科学院与河北省共同组建了“中国科学院石家庄农业现代化研究所”。2002年，与中国科学院遗传与发育生物学研究所进行整合，成立了“中国科学院遗传发育所农业资源研究中心”，保留独立事业单位法人。战略定位：以保障国家粮食安全、水安全与生态安全的战略需求为目标，以农业水资源高效利用研究为核心，创新资源生态学理论与资源节约型现代农业技术体系，强化技术成果转化与社会化服务，将农业资源研究中心逐步建设成为国内外有影响力的创新单元。
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中国科学院昆明动物研究所
中国科学院昆明动物研究所成立于1959年4月，其前身为昆虫研究所紫胶站。1963年曾改名为中国科学院西南动物研究所，1970年划归云南省后，改名为云南省动物研究所，1978年重归中国科学院，恢复原所名。中国科学院昆明动物研究所围绕“一三五”发展规划，确定了立足西南及东南亚丰富的生物多样性资源，凝练了“重大疾病灵长类新型动物模型创制与新药研究”、“基因组进化的理论突破”、“家养动物及其野生近缘种基因资源发掘”等三个重点突破方向。
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中国社会科学院近代史研究所
中国社会科学院近代史研究所，是国家级专业中国近代历史研究机构，主要研究1840—1949年间的中国历史，内容涉及这一时期的政治、军事、经济、外交、思想、文化、社会等领域和香港、澳门、台湾地区的历史。其前身为建于1938年的延安马列学院历史研究室，1950年5月1日成立中国科学院近代史研究所，1977年5月改称现名。现设有：晚清史研究室、近代经济史研究室、近代社会史研究室、近代思想史研究室、革命史研究室、中华民国史研究室、近代中外关系史研究室、台湾史研究室、抗日战争史研究室、近代文化史研究室、近代通史研究室、《近代史资料》编译室、所刊编辑部（包括《近代史研究》、《抗日战争研究》Journal of Modern Chinese History等3个编辑部）、综合处。学术团体有：中国史学会、中国现代文化学会、中国抗日战争史学会、中国孙中山研究会、中国中俄关系史研究会。研究中心有：中国社会科学院台湾史研究中心、中国近代思想研究中心、中国近代社会史研究中心、中日历史研究中心、近代以来中国历史学知识体系研究中心。
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当代中国研究所
当代中国研究所是1990年6月28日经中共中央批准成立的。当代中国研究所的主要任务是研究、编纂和出版中华人民共和国史，搜集和编辑有关国史资料，参与国史的宣传与教育，联系与协调各地区、各部门的国史研究工作。所内设办公室、科研办公室和政治史研究室、经济史研究室、文化史研究室、社会史研究室、外交史与港澳台史研究室、理论研究室8个机构，事业编制100人。研究所致力于中华人民共和国史学科建设。建有面向全国征文的国史学术年会制度和每五年举办一次的当代中国史国际高级论坛制度，至今已举办9届年会和两届国际论坛。与俄罗斯科学院远东研究所签订了长期科研合作交流协议，并接收国内外的访问学者。主办关于中华人民共和国史的专业期刊——《当代中国史研究》（双月刊）和专业网站——中华人民共和国国史网；主办国家一级学术社团——中华人民共和国国史学会；主管当代中国出版社。
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山西省考古研究所
山西省考古研究所隶属于山西省文物局，是全省唯一具有考古发掘团体领队资格的单位，担负着山西境内地下文物的调查、发掘、研究和保护等工作任务。
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自然资源部海洋发展战略研究所
战略所是目前中国唯一的部委所属专门研究海洋战略、政策和法律问题的厅局级研究所。战略所创立于1987年。战略所下设海洋权益与法律、海洋政策与管理、海洋经济与科技、海洋环境与资源四个研究室和综合办公室、党办（人事处）以及中国海洋法学会。
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云南省文物考古研究所
云南省文物考古研究所成立于1959年，是云南唯一具有考古发掘资质和文物保护工程勘察设计甲级资质的机构。主要承担云南省境内的文物考古调查、勘探、发掘和研究，以及地面文物保护工程的勘察设计、技术咨询、科技保护、监督和评估，并对全省各州(市)、县(区)的文物工作进行业务指导，同时积极开展面向东南亚、南亚国家的文物考古工作。
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