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中国科学院兰州化学物理研究所
中国科学院兰州化学物理研究所（简称兰州化物所）始建于1958年，由原中国科学院石油研究所催化化学、分析化学、润滑材料三个研究室迁至兰州而成立，1962年6月启用现名。兰州化物所目前主要开展资源与能源、新材料、生态与健康等领域的基础研究、应用研究和战略高技术研究工作。战略定位是“西部资源与能源化学和新材料高技术创新研究基地”。
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中国科学院等离子体物理研究所
中国科学院等离子体物理研究所（简称“等离子体所”，英文缩写为ASIPP），成立于1978年9月，其前身为“合肥受控热核反应研究实验站”。主要从事高温等离子体物理、磁约束核聚变工程技术及相关高技术研究和开发，以探索、开发、解决人类无限而清洁的新能源为最终目的。等离子体所是中国热核聚变研究的重要基地，在高温等离子体物理实验及核聚变工程技术研究处于国际领先水平。等离子体所现有13个研究室、3个中心、1个专项办公室、1个综合管理部门和多个高技术公司。等离子体所编辑出版的国内等离子体专业唯一的英文学术期刊《Plasma Science and Technology》，已被EI、SCI、SA等国际重要数据库收录，影响因子不断攀升。
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中国科学院理论物理研究所
1978年6月邓小平副总理亲自批准成立理论物理研究所，1985年成为中国科学院向国内外首批开放的研究。总体战略目标：联合国内理论物理学工作者，把理论物理所办成从事理论物理最基本核心问题研究，不断为国家输送优秀人才、注重交叉学科理论发展的“基础研究中心、人才培养基地、学术交流平台”。努力把理论物理研究所建设成为国际公认的、国内同行认同的，具有国际一流水平的国家理论物理中心。六个研究方向：量子场论和物质微观结构理论，弦理论与宇观结构理论，引力理论与天体宇宙学研究，凝聚态理论，非线性科学与理论生物物理兼生物信息学，量子物理与量子信息。
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中国科学院工程热物理研究所
工程热物理研究所的前身系吴仲华先生1956年创建的中国科学院动力研究室，目前已经建设成为以“动力与电气工程”和“能源科学技术”并举的战略高技术研究所。
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中国科学院地球化学研究所
研究所成立于1966年2月，由中国科学院地质研究所地球化学研究室、昆明地质工作站和中科院贵阳化学所等单位合并组成。几代地化所人开拓进取，努力前进。重视学科建设，在我国建立和发展了以矿床地球化学、环境地球化学、第四纪地球化学、天体化学、实验地球化学、有机地球化学、同位素地球化学、元素地球化学、构造地球化学、流体包裹体地球化学为主的地球化学学科体系；重视队伍建设，是我国首批硕士、博士学位授权单位和首批博士后流动站建站单位，在所学习和工作的14位科学家先后当选院士；重视实验室建设，是全国建立了两个以上国家重点实验室的少数科研机构之一；重视学术交流，创建了全国一级学会—中国矿物岩石地球化学学会，为推动全国同行的学术活动发挥了重要作用；重视科技创新，取得了包括获国家科技进步特等奖和国家自然科学一等奖在内的一系列重大成果，为地球科学的发展和国民经济建设做出了重要贡献。
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中国科学院光电技术研究所
光电技术研究所始建于1970年，是中国科学院在西南地区规模最大的研究所。光电所主要研究领域及学科方向包括：光电跟踪测量、光束控制、自适应光学、天文目标光电观测与识别、先进光学制造、航空航天光电设备、微纳光学及微电子光学、生物医学光学等。光电所建有微细加工光学技术国家重点实验室、中国科学院光束控制重点实验室、中国科学院自适应光学重点实验室等9个创新研究室，以及中科院成都几何量及光电精密机械测试实验室；还建有精密机械制造、先进光学研制、轻量化镜坯研制、光学工程总体集成、质量检测等5个研制中心，以及科技信息中心等技术保障中心。
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中国科学院南京地质古生物研究所
中国科学院南京地质古生物研究所成立于1951年，其前身为前中央研究院地质研究所及前中央地质调查所等机构的古生物室(组)，目前是我国唯一的从事古生物学(古无脊椎动物学与古植物学)和地层学研究的专业机构。
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中国科学院古脊椎动物与古人类研究所
中国科学院古脊椎动物与古人类研究所（简称“中科院古脊椎所”）最早前身是农矿部地质调查所新生代研究室，1929年4月成立于北京，主要从事周口店北京猿人遗址的发掘及化石研究。1951年归入在南京创建的中国科学院古生物研究所，改称新生代与脊椎古生物研究组。1953年从古生物研究所分出，在北京建立中国科学院古脊椎动物研究室。1957年升格为古脊椎动物研究所。1960年改称为中国科学院古脊椎动物与古人类研究所至今，现位于北京市西城区西直门外大街142号。研究所面向国际学术前沿和国家战略需求，充分发挥化石资源优势，以建设国家古脊椎动物与古人类学基础研究领域的科研和学术思想中心、科技人才培养中心、化石标本和现代骨骼标本收藏中心和科学普及中心为发展定位，力争率先进入世界著名研究所行列，保持我国古脊椎动物与古人类学基础研究在国际上的先进地位，在提高人类对生命与地球演化规律认识等方面做出重大创新贡献。
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中国科学院华南植物园
中国科学院华南植物园是我国历史最悠久的植物学研究机构之一，前身为国立中山大学农林植物研究所，由著名植物学家陈焕镛院士于1929年创建。1954年改隶中国科学院并易名中国科学院华南植物研究所，1956年建立华南植物园以及我国第一个自然保护区―鼎湖山国家级自然保护区，2003年10月更名为中国科学院华南植物园。2018年以来，华南植物园实现整体进入中国科学院核心植物园，部分进入南海生态环境工程创新研究院、种子创新研究院和药物创新研究院的“率先行动计划”总目标。
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中国科学院分子植物科学卓越创新中心
分子植物卓越中心是基于植物生理生态研究所而新建的实体化运作的四类机构，自2020年3月16日起成为中国科学院直属的独立事业法人科研机构。植物生理生态研究所系由原中国科学院上海植物生理研究所与原中国科学院上海昆虫研究所于1999年5月19日整合而成。分子植物卓越中心将聚焦植物遗传、发育、生理及其与环境互作的重大基础科学问题及科技前沿，开展原创性、系统性的基础和应用基础研究，为现代农业、生态环境和人民健康服务。五个重点培育方向：植物生长发育的分子机理，植物表观遗传调控机制研究，昆虫-微生物-植物分子互作，昆虫发育与环境适应的分子机制，人工合成生物与先进生物制造。
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